La historia del Servicio de Nefrología comenzó en 1963 con la apertura de la Unidad Metabólica, un espacio de 244 m² que marcó el inicio de la atención especializada en enfermedades renales en el hospital. Solo unos años después, en 1967, se logró un gran avance al realizarse el primer trasplante renal, un logro importante para la medicina en la región.

En 1976 se hizo una remodelación del área física, y al año siguiente, en 1977, se inauguró oficialmente la especialidad de Nefrología avalada por el Consejo Universitario, lo que permitió comenzar con la formación de especialistas en este campo.

Para 1992, el Dr. Jesús Cruz Valdez tomó la jefatura del servicio. Ese mismo año se obtuvo la certificación por el Consejo Mexicano de Nefrología y se inició la atención con 4 máquinas de hemodiálisis, lo cual fue un gran paso para los pacientes con enfermedad renal.